Préchauffez le four à 375°F (190°C).

Portez une grande casserole d'eau à ébullition. Faites cuire les pâtes 2 minutes de moins que les instructions du paquet. Égouttez et rincez à l'eau froide jusqu'à ce qu'elles soient froides.

Chauffez une grande poêle à feu moyen. Ajoutez la saucisse italienne, l'oignon, le poivron et l'ail; faites cuire et remuez jusqu'à ce que la saucisse soit bien cuite.

Ajoutez la sauce marinara, l'assaisonnement italien et les flocons de piment rouge écrasés, si utilisé. Faites cuire à feu moyen pendant 10 minutes, en remuant de temps en temps, pour mélanger les saveurs.

Étalez 2 tasses de sauce au fond d'un plat de cuisson de 9x13 pouces.

Mélangez dans un bol le fromage cottage, 1 tasse de fromage mozzarella, 1/4 de tasse de fromage parmesan et le persil.

Répartissez le mélange de fromage entre les coquilles de pâtes, en remplissant chaque coquille avec environ 1 cuillère à soupe.

Disposez uniformément les coquilles sur la sauce dans le plat de cuisson.

Versez le reste de la sauce sur les coquilles et saupoudrez avec le reste de fromage mozzarella et parmesan.

Enfournez, à découvert, jusqu'à ce que le fromage soit fondu et la sauce bouillonne, environ 25 minutes. Couvrez légèrement de papier aluminium si cela commence à trop brunir.