Kumpulkan semua bahan. Panaskan oven hingga 400°F (200°C).

Panggang kerak pai dalam oven yang sudah dipanaskan sampai kokoh, sekitar 8 menit. Angkat kerak dari oven dan sisihkan. Turunkan suhu oven menjadi 350°F (175°C).

Panaskan minyak zaitun dalam wajan besar dengan api sedang. Tambahkan bawang, paprika, jamur, dan zucchini lalu masak sambil diaduk hingga melunak, sekitar 5 hingga 7 menit. Angkat sayuran dari wajan dan sisihkan.

Taburi irisan tomat dengan tepung dan kemangi; masak dalam wajan di atas api sedang selama 1 menit per sisi. Sisihkan.

Kocok telur, susu, garam, dan merica bersama-sama dalam mangkuk kecil.

Sebarkan 1 cangkir keju di dasar kerak pai. Susun campuran sayuran di atas keju, lalu tutup dengan irisan tomat. Tuangkan campuran telur di atasnya dan taburi dengan sisa 1/2 cangkir keju.

Panggang dalam oven yang telah dipanaskan hingga pisaunya dimasukkan dekat tengah keluar bersih, sekitar 40 hingga 45 menit.