Precalienta el horno a 350°F (175°C). Engrasa un molde para hornear de 9x13 pulgadas.

Calienta el aceite de oliva en una sartén grande a fuego medio. Agrega la cebolla y el ajo; cocina hasta que la cebolla esté transparente, aproximadamente 5 minutos.

Incorpora los calabacines, el calabacín amarillo y el pimiento; cocina, revolviendo con frecuencia, hasta que los calabacines y el calabacín amarillo estén tiernos, aproximadamente 10 minutos.

Agrega los frijoles negros, la salsa verde, el comino y la pimienta de cayena; cocina y revuelve hasta que espese, de 5 a 8 minutos.

Reparte un paquete de queso estilo mexicano entre las tortillas. Coloca el relleno de calabacín encima del queso en una línea en el centro de cada tortilla.

Dobla los bordes opuestos de las tortillas para cubrir el relleno. Enrolla un borde alrededor del relleno, creando un burrito; colócalo con la costura hacia abajo en el molde preparado.

Hornea en el horno precalentado hasta que el queso se haya derretido y los burritos estén calientes, aproximadamente 15 minutos.