Lleva el agua a ebullición en una cacerola a fuego alto y agrega el arroz. Reduce el fuego a medio-bajo y cocina, sin tapar, durante 7 minutos; escurre bien.

Usando la misma cacerola, lleva la leche a ebullición a fuego medio-alto. Incorpora el arroz, la vaina de vainilla y la sal. Reduce el fuego a medio-bajo y cocina a fuego lento, revolviendo con frecuencia, hasta que el arroz esté muy suave y haya absorbido la mayor parte de la leche, de 15 a 18 minutos. Retira la cacerola del fuego, desecha la vaina de vainilla y mezcla el azúcar.

Precalienta el horno a 350°F (175°C). Engrasa un molde para hornear de 2 cuartos.

Vierte la mitad de la mezcla de arroz en un tazón grande. Agrega el puré de calabaza, la canela molida, el jengibre molido y la nuez moscada molida. Coloca el pudín de arroz con calabaza en el molde preparado. Mezcla las pasas con la mezcla de pudín de arroz restante, y colócalo sobre el pudín de arroz con calabaza.