Lleva el agua y la quinoa a ebullición en una cacerola. Reduce el fuego a medio-bajo, tapa y cocina a fuego lento hasta que la quinoa esté tierna y el agua se haya absorbido, de 10 a 15 minutos. Reserva para que se enfríe.

Mientras tanto, bate el aceite de oliva, el jugo de lima, el comino, la sal y los copos de pimiento rojo en un tazón pequeño.

Combina la quinoa, los tomates, los frijoles negros y las cebollas verdes en un tazón grande. Vierte el aderezo sobre la mezcla de quinoa; mezcla para cubrir. Añade el cilantro; sazona con sal y pimienta negra.