Corte os bulbos de funcho ao meio no sentido longitudinal. Remova os núcleos duros. Fatie finamente o funcho. Corte as cebolas ao meio no sentido longitudinal e também fatie finamente.

Aqueça o azeite em uma frigideira grande em fogo médio. Adicione o funcho e as cebolas; cozinhe e mexa até que as cebolas fiquem translúcidas, cerca de 8 minutos. Adicione o vinho e cozinhe até que o vinho tenha quase evaporado e o funcho e as cebolas comecem a dourar, cerca de 8-10 minutos.

Leve para ferver uma panela grande com água levemente salgada. Cozinhe o linguine até ficar macio, mas firme ao morder, aproximadamente 11 minutos. Reserve 1/4 de xícara da água do cozimento da massa e escorra o linguine, mantendo-o aquecido.

Misture os tomates à mistura de funcho; cozinhe até amolecer, cerca de 3 minutos. Misture o suco de limão e os pinhões.