Derreta 5 colheres de sopa de manteiga em uma frigideira grande, profunda e pesada ou em uma panela de ferro fundido de 8 litros em fogo médio. Adicione as cebolas e 1/4 de colher de chá de sal. Misture para cobrir na manteiga. Cozinhe, tampado, mexendo ocasionalmente, até que as cebolas estejam macias, cerca de 15 minutos. Aumente o fogo para alto. Cozinhe, mexendo sempre, até que as cebolas comecem a dourar, de 3 a 5 minutos.

Reduza o fogo para médio e adicione o alho; cozinhe, mexendo, até ficar perfumado, cerca de 1 minuto. Adicione a pasta de tomate. Cozinhe, mexendo constantemente, até que a mistura comece a escurecer, de 1 a 2 minutos. Adicione o vinho à frigideira, depois use uma colher de pau ou espátula para raspar quaisquer pedaços dourados do fundo da panela. Deixe ferver por 2 minutos.

Adicione o caldo, folhas de louro, tomilho, flocos de pimenta vermelha e cravos. Leve para ferver. Reduza o fogo para baixo; deixe ferver, mexendo ocasionalmente, até que o líquido reduza e as cebolas fiquem em consistência de geleia, com apenas um pouco de líquido nas bordas da frigideira, cerca de 25 minutos.

Enquanto o molho cozinha, cozinhe a massa conforme as instruções da embalagem. Escorra, reservando 1/2 xícara de água do cozimento. Retire o molho do fogo.